多波束是一种测深工具而并非成像系统，无法直接在记录纸上进行打印，必须先构建数字地形模型(DTM)，再根据DTM构建地貌影像图，从而能够反映细微的地形起伏所导致的坡度和坡向变化；此外，多波束的中央波束探测效好，边缘波束效果差;多波束采用三维可视化的方法进行目标判断，在3D GIS系统中可以直接提取目标物的平面位置和高度，还能够从不同的角度进行观察，便于掌握目标物的形状特征。但是，除非我们在进行测深的同时采集反向散射强度信息，否则我们无法得到与目标物的底质类型相关的信息，因此，多波束比较适合于沉船或者管线等容易根据形状进行判断的目标。

现在的侧扫声呐技术有两个缺点，首先它的横向分辨率取决于声纳阵的水平角宽，分辨率随距离的增加而线性增大，其次它给不出海底的准确深度。当前只有两种声纳可做海底三维成像，即等深线成像和反向散射声成像，前一种是多波束测深声纳，后一种是测深，总体说来，前者适宜于安装在船上做大面积测量，后者适宜于安装在各类水下载体上，包括拖体、水下机器人(AUV)、遥控潜水器(ROV)和载 人潜水器(HUV)，进行细致的测量。